Los participantes del Yajna meditan para limpiar su corazón y su alma, con el propósito de obtener las bendiciones de seres divinos y de sus ancestros. Una vez realizado ésto, hacen un anillo de hierba Dharba y lo colocan en el dedo anular de su mano derecha para repeler las energías negativas.

Unas vasijas llamadas Panchapatras se llenan de agua, dichas vasijas deben ser hechas preferentemente de una aleación especial de 5 metales o en su defecto ser de plata o cobre únicamente. Posteriormente cada participante toma agua de éstas vasijas con una cuchara especial, se sorbe un poco y otro poco tres veces y después se rocía otro poco en la cabeza con el pulgar. Se pronuncia el mantra apropiado para cada deidad y todo ésto se realiza para purificar el cuerpo y la mente de los participantes. Lo anterior se realiza mientras se está viendo en dirección norte o este, únicamente, ya que son las direcciones propicias. Se pronuncian a continuación los 12 nombres de Dios y simultáneamente se tocan diversas partes del cuerpo utilizando un dedo específico para cada caso.  Lo anterior simboliza que todos los sentidos están dedicados al servicio de Dios.

Como es tradicional, el dios Ganesha es siempre adorado al inicio de cualquier ritual, solicitando así sus bendiciones para que todo el ritual se pueda realizar sin obstáculos de ningún tipo. Ganesha es comunmente invocado utilizando una figura cónica hecha de bermellón mezclado con agua. Este material es considerado como muy auspicioso y propicio. A continuación se realizan 16 ofrendas a Ganesha mientras se pronuncia uno de sus himnos. Las 16 ofrendas consisten de; un trono para sentarse, lavado de pies, lavado de manos, ofrecimiento de agua para beber, baño ceremonial con agua sagrada, prendas nuevas de vestir,  unguentos de pasta de sándalo y perfumes, adornos de joyas, flores, incienso, lámpara de fuego, comida (frutas y dulces), además de postraciones solicitando sus bendiciones.

Éste momento es muy especial, ya que es aquí cuando se invoca a la deidad principal del Yajna a ser realizado. La deidad es invocada mientras se energiza la vasija sagrada (kalasha), que está llena de agua, en donde se le adora y un coco y hojas de mango son ofrecidos. A su vez la vasija es cubierta por tela y adornada con diversas flores. Posteriormente la vasija es colocada en dirección norte o este de la estructura en donde se realizará el Yajna.

Cada Yajna se realiza con un propósito determinado. En ésta fase se declara verbalmente la intención de realizar el Yajna específico, para el beneficio de los participantes que en éste caso son los patrocinadores de cada Yajna, cuyos nombres completos y su correspondiente estrella fija de nacimiento (nakshatra) son leídos en voz alta, para lo cual fue necesario realizar previamente el análisis de la carta astral védica de nacimiento de cada participante (patrocinador) en base a la fecha, lugar y hora exacta de su nacimiento. También en éste momento se invita a la deidad de forma ritual y reverente al lugar en donde se practicará el Yajna.

Aquí se santifica mediante mantras la estructura en donde se encenderá la hoguera del fuego sacrificial. Cabe señalar que para la hoguera solo se utiliza madera de ciertos árboles y normalmente proviene del árbol denominado Pipal. El sacerdote védico (pandit) canta mantras mientras al mismo tiempo enciende el fuego sagrado del Yajna, ofrece mantequilla clarificada al fuego y se medita en Agni (dios védico del fuego). Agni es el dios que sirve de mediador entre éste mundo y las dimensiones espirituales. Los sacerdotes védicos meditan en la deidad a quien se dirige el Yajna y se aseguran en todo momento que el Yajna sea realizado observando estrictamente las antiguas escrituras védicas y demás convenciones acostumbradas para cada caso, así se procede a realizar propiamente el yajna mientras se vierten al fuego sagrado todas las ofrendas adecuadas y agradables para cada deidad, mientras al mismo tiempo con cada ofrenda el o los sacerdotes védicos (pandits) pronuncian mantras un número determindado de veces, siendo ésta la parte principal de todo el ritual. Entre más ofrendas, mantras y sacerdotes el Yajna produce más y mejores beneficios a los participantes (patrocinadores) del mismo.

La negación del ego y la entrega total a la divinidad es parte del ritual, por lo que a continuación se realizan postraciones frente al fuego sagrado del Yajna.

Ya hacia el final del Yajna se hacen diversos ofrecimientos de comida a Dios, los cuales son preparados especialmente para la ocasión.

Una lámpara de alcanfor es encendida y acercada varias veces a la imágen de la deidad, mientras al mismo tiempo se hacen resonar campanas, la lámpara posteriormente es acercada a todos los asistentes del Yajna, quienes acercan su mano para tocar simbólicamente y de forma reverente la llama (sin hacer contacto físico).

Mientras los sacerdotes védicos (pandits) continúan pronunciando los últimos mantras, el fuego sagrado del yajna se va haciendo menos intenso y queda solo una gentil flama.

Así como se le invitó a la deidad del Yajna, ahora se procede a agradecer sus bendiciones y se le desea un buen regreso a su aposento celestial. En algunas ocasciones y dependiendo del yajna específico se pueden o no realizar a su vez los siguientes procedimientos:
a).-Pradakshinam.- Circumabalar la imágen de la divinidad.
b).-Abishekam.- Bañar a la imágen de la divinidad con diversas sustancias tales como leche, yougurt, miel, mantequilla derretida, aceite, agua de rosas, pasta de sándalo, entre otras.
c).-Dhoopam.- Ofrecimiento de diversos inciensos.
d).-Deepam.- Una lámpara de cinco puntas bien decorada es ofrecida.
e).-Archana.- Similar a un puja, se realiza solo en templos hindús, pronunciando ciertos mantras y realizando ofrendas a la deidad, tales como cocos, flores, frutas y hojas de betel.